鳞状细胞相关抗原主要是为了检查被监测者是否有肿瘤病变，鳞状细胞相关抗原是用于辅助诊断鳞状细胞癌的一项血液学肿瘤指标，此项肿瘤指标在正常情况下维持在一个较低的水平。
而如果某些癌症患者，尤其是某些鳞状细胞癌患者，常会出现此项指标升高，例如肺鳞癌、皮肤鳞癌、食管鳞癌以及宫颈鳞癌患者，临床上常会检测到鳞状细胞相关抗原明显高于正常值，并且随着病情的变化出现持续升高。
随着鳞状细胞癌被有效控制，此项指标也会下降，并恢复正常。鳞状细胞相关抗原在某些良性病变中，如某些鳞状细胞增生或炎性病变，也可能会出现指标轻度偏高。及时给予抗感染、消炎等处理后，大多数良性病变引起的升高会恢复到正常水平。
