胃底贲门癌，通常5年存活率可达50%-60%，但胃底贲门癌总的存活率，取决于是早期癌还是进展期癌。早期癌转移风险较低，故5年存活率更高，通常可达5-10年。若发现较晚，则患者的存活周期较低，通常为2-3年。

胃底贲门癌存活率，应根据胃底贲门癌的性质、分化程度、是否有远处转移而定。肿瘤分化程度越低，则恶性度越高，远处转移时间越早，远处转移机会越高，则患者的存活周期越短。及早发现胃底贲门癌，即使是分化程度低的癌，亦可根治，5年生存率或10年生存率均较高，通常可较早得到根治，达到临床治愈。若在早癌时段发现贲门癌或胃底癌，即可及早进行内镜下干预，达到临床治愈。