肛门痛需要根据原因，采取不同的药物治疗，建议最好去医院看结直肠外科、结直肠肛门外科、肛肠外科的医生，检查肛门周围有无其他疾病，常见药物及治疗方法，按病因分为以下几点：

1、肛裂：特点是排便时疼，排便后还会有一阵疼痛，是节律性疼痛。此时可以应用药膏，如止痛膏，包括复方利多卡因乳膏，同时可以应用银离子痔疮抑菌凝胶，一方面可以止痛，另一方面可以促进创面愈合，或者用太宁软膏和马应龙痔疮膏；

2、陈旧性肛裂：可能需要手术治疗；

3、肛周脓肿：肛门周围有炎症、脓肿，则可能需要手术治疗，再辅助抗生素，即消炎药，一般要用头孢类抗生素，辅助奥硝唑、甲硝唑类的抗厌氧菌的药物；

4、肿瘤：肛门周围出现肛管癌、恶性黑色素瘤等，可能需要手术治疗或放疗；

5、炎性或血栓性外痔：一般需要手术治疗；

6、内痔：需要手术治疗，另外再辅助治疗痔疮的药膏，或口服减轻静脉曲张、水肿的药物。