服用藿香正气水的同时，尽量避免饮酒。若在感冒期间大量饮酒，一方面容易助湿生热，加重人体内湿热症状，一方面不利于感冒痊愈。藿香正气水药品说明书也提到，用药期间应注意清淡饮食、忌烟酒，避免食用辛辣、油腻、刺激食物。同时提到不良反应，主要包括胃肠道不良反应，包括恶心、呕吐等。若在用药同时再大量饮酒，可能加重不良反应症状。
由于藿香正气水是复方中成药，药物组成包括苍术、陈皮、厚朴、白芷、茯苓、半夏、大腹皮、广藿香、紫苏叶油等，具有芳香挥发成分。从治疗疾病考虑，主要是解表化湿、理气和中，用于治疗外感风寒、内伤湿滞所导致的头痛、头昏、脘腹胀痛、呕吐、腹泻，包括夏季常见的胃肠型感冒，会用藿香正气水治疗。
