高锰酸钾无法治疗细菌性阴道炎，通常需要使用甲硝唑或者克林霉素治疗。细菌性阴道炎即细菌性阴道病，由于阴道局部优势菌，乳酸杆菌减少，异常菌群加德纳杆菌等增多所导致，出现分泌物增多、异味、外阴瘙痒等症状。妇科检查可以观察到阴道内有大量稀薄的白带，BV检测阳性。
治疗上需要针对加德纳杆菌等细菌治疗，比如甲硝唑或者克林霉素，可以口服也可以阴道上药。另一方面，可以促进局部乳酸杆菌恢复，可以使用含有活菌的阴道胶囊治疗。但是高锰酸钾作为超强的氧化剂，虽然具有消毒作用，但无法治疗加德纳杆菌。
如果发生细菌性阴道炎，应该给予口服抗生素，或者阴道使用抗生素，同时阴道使用含有活菌的阴道胶囊。单纯使用高锰酸钾溶液，通常只能缓解症状，无法达到治愈的效果，不可单独使用。
