酸奶对大部分患者的胃有一定好处，能够促进消化、吸收，同时口感较好，但是对胃酸分泌偏高的患者则有一定坏处。胃酸分泌状态高的患者是指胃食管反流、酸反流，可能存在胃部糜烂、溃疡，甚至恶性肿瘤，患者胃酸分泌通常偏高。恶性肿瘤是指胃窦部、贲门部位的恶性肿瘤，胃酸可能出现偏高，而以胃体为主的恶性肿瘤，由于肿瘤侵犯，同时患者本身存在萎缩，胃酸分泌可能会下降。
对于胃食管反流、酸反流患者，以及出现胃溃疡、糜烂的患者，不建议食用酸奶，可以饮用纯牛奶。由于纯牛奶中富含钙质，如果食用后出现胃脘难受、疼痛，也需要暂停食用，酸奶则更加不提倡。特别是存在胃酸缺乏的患者，如自身免疫性、萎缩性胃炎的患者，食用酸奶能够促进消化、吸收，而且食用后感觉胃脘较为舒适，可以通过自身的反应对于能够饮用酸奶进行判断。如果食用后较为舒适，还可以继续食用，但如果食用后出现胃疼、反流，则应该避免食用。
