激光点痣和药水点痣中，通常激光点痣的效果更好，并且治疗更为彻底、损伤更小。由于后续的复发率较高，目前基本已经淘汰药水点痣。激光点痣临床上，通常采用二氧化碳激光进行治疗。痣实际为黑素细胞良性的增生，在局部形成痣细胞槽，槽中有较多黑素细胞，如果需要通过点痣彻底治疗，需将局部的痣细胞全部消灭。二氧化碳激光作用的靶标是水分子，通过使水受热气化，使细胞和组织气化，起到治疗作用。
治疗常见的不良反应，为局部形成瘢痕。如果较大的痣，可能深度、宽度也较大，通过激光可能无法完全去除，并且可能范围较深，较容易导致凹陷性的瘢痕。所以如果痣较深，通常不应用激光治疗，否则反复多次点痣，可能刺激细胞，反而升高癌变的概率。所以较小的痣，如＜3-4mm，可以通过激光点痣治疗，但是如果＞3-4mm，或者痣较为突起，并不应用激光治疗，最好通过手术进行切除。
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