引起患者耳根一阵一阵痛，常见原因如下：

1、急性中耳乳突炎：是最常见的原因，炎症会蔓延到乳突部位，从而导致耳后乳突部的皮肤可以充血、肿胀、压痛非常明显，同时伴有耳根部的一阵一阵的疼痛。治疗方法主要是全身抗炎治疗，同时给予滴耳剂局部抗炎治疗；

2、鳃裂囊肿感染：鳃裂囊肿是先天性疾病，主要是由于第一鳃裂发育异常所引起，在耳后形成瘘口，或者是窦道，当鳃裂囊肿感染时，会出现周围皮肤红、肿、疼、痛，同时会肿胀隆起，形成脓肿有波动感。治疗方法主要是以抗生素治疗，以及局部的抗生素软膏的涂抹。如果形成脓肿后就要切开引流换药，才能达到愈合。愈合后应当及时采取手术切除的方法，防止再一次发作；

3、带状疱疹病毒感染：会引起耳后皮肤剧烈疼痛，同时可能会有小的红色丘疹，严重时，还会引起患者面神经麻痹，以及听力下降和眩晕。