手足口病最基本的特征是在患儿的手、足、肛周长皮疹，所以叫手足口病，皮疹不痛不痒、不结痂、不留疤、不起水泡等，皮疹是手足口病最典型的特征，有的患儿在口腔里会长疱疹、咽峡炎，影响患儿的进食，流口水增多，这都是手足口病的基本的特征。
同时因为手足口病是病毒感染，大部分患儿会伴有发热，发热程度不一，轻症患儿发热主要表现是低到中度的发热，重症患儿体温可能会是高热，甚至是持续的高热。
整体来说手足口病是以皮疹和发热为基本特征，是轻症病例的典型表现。手足口病大部分占到95%的是轻症病例，少部分患儿是重症病例，重症病例的表现除了基本的手足口皮疹和发热外，可能会出现神经系统、心血管系统、呼吸系统的严重的并发症。如脑干脑炎，病人会表现为惊厥、抽搐、肢体抖动等，呼吸循环的衰减。
如果患儿一旦出现心血管系统、神经系统的严重并发症，就是重症病例，需要积极抢救治疗，个别患儿因为出现严重的并发症，可以导致生命的危险。
