对于胆囊癌的发病而言，多数认为是由长期反复胆囊炎症引起，部分则是和某些具有潜在癌变风险的胆囊息肉、胆囊腺肌症有一定的相关性。目前发现大多数的胆囊癌患者，都是在胆囊结石，合并慢性胆囊炎基础上形成。
长期反复发作的慢性胆囊炎、较大的胆囊结石、胆囊壁明显增厚、合并钙化，或者是某些特异性的胆囊炎症，像黄色肉芽肿性胆囊炎，都可能会增加胆囊癌的发病风险。所以，对于胆囊结石，合并反复发作胆囊炎的患者，建议尽早通过胆囊切除以降低胆囊癌的风险。
某些腺瘤性息肉，具有潜在的癌变风险，较大的或者是弥漫性胆囊腺肌症，也有一定发生癌变的可能。而某些遗传因素，合并有一些自身免疫性疾病，像原发性硬化性胆管炎，或者是一些免疫功能低下的患者，以及有胆囊癌家族病史的人群，也都属于胆囊癌的高危人群。
