早上空腹吐黄水、苦水，可能由胃肠道和肝胆系统疾病引起，比如胆汁反流性胃炎、胃食管反流病、慢性胃炎、胆囊炎、胆结石、肝炎、肝硬化、胃和十二指肠的肿瘤、肝胆胰腺的癌症等疾病有关。
其中胆汁反流性胃炎是幽门括约肌松弛，十二指肠中的内容物反流到胃内，对胃部造成侵蚀而引起。如果同时伴有胃食管反流病时，胆汁及胃酸可以同时越过松弛的贲门进入食管，进而逆流入口腔。由于胆汁的味道本身苦涩，所以会在呕吐的同时伴有口苦，并且吐黄水的症状。
胆囊炎、胆结石在发作期间会影响到胆汁的排泄，由于胆汁不能及时排泄出去，也会伴随着恶心、口苦、吐黄水、消化不良的表现。患有肝炎疾病的患者也会因为肝脏受到损伤，胆汁的分泌和排泄都会出现异常，也会出现口苦、吐酸水、吐黄水的情况。肝脏、胰腺肿瘤压迫也会导致胆汁排泄障碍，出现上述症状。
