阴部的毛囊炎通常是细菌感染引起，首先应针对性进行抗菌消炎治疗，包括局部外用抗菌效应药物，如碘伏、百多邦软膏、夫西地酸乳膏、鱼石脂软膏进行治疗。较严重或多发外阴毛囊炎，也可考虑内服药物，如内服头孢类、喹诺酮类抗菌素进行治疗，通常使毛囊炎很快消退。另外要针对毛囊炎的诱因进行治疗，引起外阴毛囊炎有多种原因，有可能局部清洁卫生不够，包括局部潮湿多汗，衣裤较紧不透气，容易导致局部细菌滋生、感染毛囊，引起外阴毛囊炎，要注意加强局部皮肤清洁，保持局部干爽。
外阴部毛囊炎还有可能是继发其它皮肤疾病，如局部有瘙痒症、外阴湿疹，长期反复搔抓可导致皮肤破损，细菌乘虚而入，形成毛囊炎。上述情况还需治疗阴囊瘙痒局部的湿疹，另外外阴毛囊炎可能因为基础疾病，如糖尿病、慢性肝病及肾病，或服用激素免疫抑制剂，导致机体免疫力下降引起，也需针对原发病进行治疗，才能使毛囊炎治好后不再复发。
