月经不调时做经肛门B超相对比做腹部B超更为准确，即使没有性生活甚至年龄偏小的青春期女孩，如果是由于月经不调看妇科，也建议通过肛门做B超。B超是要看子宫和双侧附件，尤其要观察子宫里边是否有月经不调的情况和观察子宫腔里有无异常。
观察内膜厚度时，离子宫越近越好。经阴道时，探头进到阴道里碰到宫颈，看得比较清楚。如果没有性生活，不能通过阴道做，则可以经肛门做。阴道和肛门之间只有一层隔，进入比较深时，观察子宫和双侧卵巢比较好，尤其是子宫内膜，因为子宫内膜异常通常与月经不调有一定关系。月经不调要了解内膜厚度，是否长息肉或黏膜下肌瘤。虽然经腹部的B超过程比较简单，但是经腹部B超要憋很大的膀胱，才能隔着膀胱看清子宫情况。如果可以接受观察，还是经肛门B超更好。
