垂体功能低下的并发症如下所述：
1、垂体功能低下不进行治疗：垂体是内分泌系统的中枢，分泌多种激素，比如分泌管理糖皮质激素的促肾上腺皮质激素、管理甲状腺的促甲状腺激素、管理性腺的促性腺激素、管理生长的生长激素以及泌乳素、垂体后叶激素等。如果垂体功能低下不去进行治疗，不进行相应的替代治疗，会出现相应的并发症，如垂体功能低下，糖皮质激素功能不良时，会导致血压、血糖无法维持，导致机体状态处于相对低落的能量状态，还会出现低血钠、容量不足等症状，严重者危及生命。对于非常严重的甲状腺功能低下，也会出现体温低、心率低等表现，较为严重者会出现黏液水肿性昏迷，从而危及生命。性腺功能低下通常会影响到女性月经以及男性生育等功能，但对生命的威胁相对较弱；
2、药物的不良反应：垂体功能低下需给予药物治疗，但通常药物会有不良反应，从而产生相应的并发症。长期激素替代治疗，会对骨骼产生负面影响，如骨质疏松等。长期服药也会造成胃黏膜的损害，造成胃炎或者消化道出血。对于肝脏的负担，时间过长或者剂量过大，会造成肝功能异常以及肝损害。对于使用生长激素过度，会造成心肌肥大、手脚肥大以及黏膜水肿等相应的不良反应。使用性激素过量，会导致性激素相关的肿瘤发生。