开胸手术风险较大，与各个医院条件、能力有很大关系。先天性心脏病首先决定手术，开胸手术是一个直视下的手术，要打开心脏，第一步必须要做开放体外循环支持。心脏手术在开胸后患者心脏会停跳，会用心脏保护液让心脏停跳，完全由机器供血、供氧，保证手术顺利完成。各个环节、各个学科配合非常重要，尤其是麻醉科等。
在手术中要密切观测患者多方面生命体征，比如血氧情况、呼吸情况、心功能状态、电解质情况，还有管路通畅等，任何一个环节出现了失误，就是致命性失误。但即使是高难度手术，在我国多年快速医疗行业积累和发展中，几乎所有先天性心脏病手术都可以完成。虽然风险较大，但在精益求精的医师对技术追求之下，还是可以完成手术。
