卵巢囊肿手术的大小取决于囊肿的性质、病变范围，如果是良性囊肿，一般不是大手术，在妇科属于中型或小型手术，如果是良性粘连，也不是很严重，一般很快就可以结束，将囊肿从卵巢上面剥离即可。但如果卵巢囊肿考虑是恶性或术中发现恶性，在妇科手术中属于比较大型的手术，因为要做分期手术，切除的范围较广泛，淋巴结的清扫，甚至有网膜也要切除，部分患者阑尾也需要切除，整个原发病灶都要切除，手术的时间较长且创伤较大，所以恶性手术是比较大的手术。
部分手术比如深部子宫内膜异位症的手术，虽然不是恶性，是良性疾病，但如果是深部子宫内膜异位症，可能会侵蚀到输尿管，甚至是肠管、直肠，侵犯到周边的组织，甚至侵犯到膀胱。为了解除患者的疼痛症状，有时手术范围较大，甚至要做输尿管的移植，部分的肠管的切除也属于妇科大手术，所以卵巢囊肿手术的大小要根据性质、病变范围的不同决定手术是大手术还是小手术。
