3个月的宝宝出现咳嗽、流鼻涕，可以通过以下的方式进行处理：

1、调整环境：可以增加环境湿度，湿度保持在55%-65%，容易使咳嗽时的痰液排出。同时也要避免鼻腔堵塞增加，可以调整环境温度，保持温度在25-27℃；

2、拍背：宝宝在咳嗽时可以经常拍背；

3、按摩：如果鼻腔堵塞、流涕比较严重，可以适当的按摩鼻翼两侧，对流涕、鼻塞也会有所缓解；

4、清理鼻腔：如果鼻子堵塞较重，可以适当的使用淡盐水冲洗鼻子、清洗鼻腔，对鼻子堵塞也会有所帮助；

5、避免自行用药：如果出现鼻塞、流涕、咳嗽时不建议自行用药，对于3个月的宝宝而言，肝肾功能发育尚未完善，这时自行用药可能会加重病情，甚至引起肝肾损伤；

6、及时就诊：有时症状可能并不典型，有时家长认为的感冒症状，经过检查可能是肺炎、支气管炎或者其它疾病的早期症状。如果宝宝出现鼻塞、流涕、咳嗽，要及时到医院就诊，由专业医生提供专业的指导之后使用专业的药物进行治疗。