在怀孕初期和月经期，CA125也会轻度升高，这种生理性升高可以自行降低，恢复正常。CA125作为一种肿瘤标志物，主要用于卵巢癌的辅助诊断，并且可以作为卵巢癌治疗的监测指标。其它恶性肿瘤，如乳腺癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、肺癌等，CA125也会有不同程度的升高。如果恶性肿瘤不进行治疗，CA125多数情况下不会自行降低。

治疗有效的患者，CA125会明显下降，复发时CA125升高先于临床症状出现，所以CA125是判断卵巢癌疗效和复发的良好指标。子宫内膜异位症、盆腔炎、卵巢囊肿、肝硬化、肝炎等患者CA125也会有不同程度的升高。以上疾病多数是良性疾病，随着病情好转，CA125会自行下降。