交叉感染引起的临床表现与其他途径引起感染的临床症状方面，没有明显的差别。临床的症状取决于感染的部位，如果是引起的肺部感染，那么患者主要表现为呼吸道的症状。

会表现为发热，伴有咳嗽或者咳痰，可以咳浓痰，也可以咳其他特殊的痰，比如白色念珠菌的感染，可以表现为拉丝状的痰或者胶冻状的痰。

如果引起的是泌尿系统的感染，患者可以出现尿频、尿急、尿疼的症状。另外，如果引起胃肠道的感染，则可以表现为腹痛，或者出现腹泻。所以不同部位的感染，临床症状也有所区别。

对于交叉感染而言，往往是在院内引起的一些耐药菌的感染，这些耐药菌感染之后，通常治疗上难度会比较大。有可能刚开始选择的抗菌药物治疗效果不好，治疗无效时，患者表现为持续性发热，而且可以出现各种伴随症状加重。

此时有可能是提示耐药菌的感染，通常需要进行细菌的培养，进行敏感试验之后，再选择比较敏感的抗菌药物进行治疗，可能才会获得治疗的效果。所以交叉感染的患者与其他的感染有所不同的方面，可能就是治疗难度上有所增加。