肠道真菌感染最常见的临床表现是每天大便有10-20次，呈水样或者是豆腐渣样，泡沫较多，颜色呈黄绿色，可伴有腹胀、低热和呕吐的情况，如果有其他基础的疾病，往往发病前应应用广谱的抗生素类药物治疗。
真菌性肠病最多见是白色念珠菌引起，而白色念珠菌是肠道正常的菌群之一，长期使用广谱抗生素或者是肾上腺皮质激素，会导致真菌的大量繁殖引起肠炎，称为真菌性肠炎。好发于儿童，尤其是营养不良或者严重衰竭的患儿。治疗上包括卧床休息，给予易消化、高热量、高维生素、低脂肪的饮食。平常可以用一些微生态制剂，比如双歧杆菌、四联活菌、乳杆菌或者是布拉式酵母菌，如果效果不好，可以同时加用抗真菌治疗，比如酮康唑、制霉菌素等药物。
