一般先天性房间隔缺损手术，因为其是简单先心病，与复杂先心病相比，其手术风险可能就比较小。
但是同其他手术相比，因为毕竟是心脏手术，如果涉及开放性手术，开胸治疗，手术风险又相对比较大，所以要比较。
综合上，如果心脏手术不是进行开放手术，而是进行封堵治疗、微创治疗，手术风险就会更小，通过比较短的进入血管进行操作，风险更小。
所以总体上整个心脏房间隔缺损手术的风险风险不大，唯一就是有的手术时机比较边缘化，如肺动压力已经很高的重病人，这种手术风险很大，甚至有的病人，如早些时候听闻的艾森曼格的病人。
当然没有手术指证是不应该进行手术，做了以后其实也不能存活。实际上还是应该早做，早期发现、诊断，最后早期进行根治，最后风险反而会更小，不会构成比较明显的、大的纰漏。
