儿童扁桃体炎根治的方法，第一个还是需要让儿童增强体质、锻炼身体、提高免疫力，以减少扁桃体发炎的概率。但是如果是此种情况下，儿童扁桃体发炎的频率还是没有下降，如每年超过3次、超过2年，这时可以给予儿童进行扁桃体切除。
通常情况下不用担心扁桃体切除，会使得儿童免疫力存在下降，对其造成影响，一般不会出现这些现象。因为较多文献已经证实，反复发炎的扁桃体切除，不会影响儿童的抵抗力，相反可能会使得其抵抗力增强。
因为扁桃体炎发作频率少，儿童出现肾小球肾炎或者心肌炎这样的一些问题，概率也是下降。对于相关手术，一般是可以选择低温等离子，或者用电刀、超声刀，或者常规的器械切除都可以选择。此种手术在耳鼻喉科还是比较简单的手术，手术差不多是0.5-1小时左右，与儿童的病情情况以及医生的经验有关。
儿童手术以后要强调在24小时之内尽量选择冷流食，减少出血的发生。手术1周之内，还是建议摄入软食，尽量避免刺激、辛辣的饮食，以及腌制的饮食摄入。同时，一定要选软食、高蛋白的一些饮食，一般2周左右才可以正常的饮食。
