卵巢的囊肿的原因很复杂，原因不是特别明确。因为卵巢是全身得肿瘤的种类最多的一个器官，可以是上皮性肿瘤，也可以是性索间质肿瘤，还可以是生殖细胞肿瘤，或者是继发性的卵巢肿瘤。

而每一类型的这种肿瘤，都可能分为良性、恶性，和交界性，除了真正的卵巢肿瘤之外，还可能是卵巢的生理性囊肿，就是正常月经周期中存在着，然后随着月经过了，也就没了，一般这种多是指黄体囊肿。有的时候，大夫会把发育的卵泡说成是囊肿。

所以对于卵巢囊肿的原因不是很明确的，而且囊肿有可能是良性的，也有可能是恶性的，如果是继发性的卵巢肿瘤，一般是实性的多一些，继发于胃肠道的肿瘤，一般是实性的多一些。

所以卵巢囊肿一般要看囊肿的形态是不是规则的，里面是不是有分隔，分隔里边是否有血流信号，有没有实性的突起，突起上有没有血流信号，肿瘤标记物是如何的，通过这些就可以大致帮助判断良恶性。具体是良性还是恶性，其实还要靠手术去做病理才知道的。

另外有一些人会把输卵管的囊肿，误认为卵巢的囊肿，因为输卵管和卵巢是挨得特别近的两个器官，有的输卵管长了系膜囊肿了，或者输卵管出现积水，也可能误把它当为卵巢囊肿，这都是有可能的。