儿童扁桃体化脓是急性细菌感染，最快的治疗方法是选用敏感的抗菌素进行治疗。扁桃体化脓通常为链球菌或葡萄球菌感染，因此应用青霉素类或头孢类的抗菌素疗效最好。最常用的方式都是口服，也可以根据病情选择肌肉注射或静脉输液，大部分口服即可。
如果伴随有发热症状，可以应用解热镇痛的药物，如退热药，这个治疗最快；如果扁桃体化脓频繁发作，对身体的确有潜在危险，不好，频繁指1年在2-3次以上。建议手术切除扁桃体，因为是病灶性疾病，容易对身体造成免疫反应，引起继发的比如心肌炎或肾炎。
因此，急性化脓时是急性感染，最主要的是消炎治疗，同时对症控制症状，一般1周之内症状即可缓解。
