宫颈囊肿和同房出血无太大关系，同房出血通常是因为宫颈的某些病变，如宫颈炎症、宫颈糜烂，以及宫颈息肉、宫颈囊肿，通常外观上较光滑。所以如果患者无上述其他因素存在，仅是存在宫颈囊肿，通常不会引起同房出血。
此外，此种出血可能并非来自宫颈阴道部，可能有宫颈管炎症存在，也可能会发生同房出血。宫颈管炎症通常肉眼观察不到，因为位于宫颈管里，所以患者能观察到宫颈表面有宫颈潴留囊肿的形成，会误认为是宫颈囊肿造成同床出血，实际上两者并无相关性。
宫颈囊肿的形成主要是宫颈腺上皮的增生堵塞腺体开口，或者是慢性炎症造成宫颈腺体周围结缔组织增生，挤压造成腺体开口狭窄，使分泌物不能排出，潴留而形成的囊性包块。
