脊索瘤在组织学上被认为是良性肿瘤。脊索瘤来源于胚胎时期的脊索组织，好发于颅底和骶椎。但脊索瘤具有恶性肿瘤特征，通常位置较深，外部无包膜，呈浸润性生长。此外，手术不易切除，且复发率非常高。

临床上将脊索瘤当作恶性肿瘤对待。脊索瘤可导致患者出现疼痛或上、下肢神经功能障碍。并且脊索瘤好发于颅底，可能会侵犯正常组织，包括脊髓和神经。因此，临床上若发现脊索瘤，应尽早进行手术切除。