如果扁桃体比较肥大，会影响牙齿矫正，扁桃体作为口咽腔的一个器官，位于咽喉要道部位，张开嘴即可看到。扁桃体上部是鼻咽腔，下部是下咽，由于人体具有代偿作用，如果扁桃体比较大，导致此部位无法正常通气。
因此，需要把上颌骨向前拉，促使气道通畅，或者下颌骨向前伸，造成反颌，即地包天。主要目的是将口咽部后面的气道打开，使鼻子吸进的空气可以顺利、有效到达气管、肺，以此进行氧气和养分交换。
因此，扁桃体肥大，会影响牙齿矫正。口腔科医生通常建议，如果有扁桃体肥大，需要先将扁桃体肥大处理。
如果扁桃体比较大，并且有反复发炎，每年发炎超过4、5次，此时要进行扁桃体全部切除。如果扁桃体大，但没有反复发炎的病史，可以进行扁桃体消融术，使扁桃体体积恢复正常，以此治愈气道通畅问题。
