肠镜检查分两种类型，一般是普通肠镜和无痛肠镜，现在还有胶囊内镜，也包含小肠检查，普通肠镜在北京地区卫生系统的定价是350元，350元只是肠镜的检查费用，不包含出报告的费用，彩色图片是50元。同时做肠镜之前要做感染性筛查，要除外乙肝、丙肝、梅毒、艾滋病这几项传染病，如果有这几项传染病，要去传染病医院或大的三甲医院去检查。
做肠镜除了抽血和肠镜检查以外，还要做心电图检查，要明确无严重的心脏疾病，如果有相关严重心脏疾病，不建议在短期内做肠镜检查。如果要做无痛肠镜检查，要涉及到麻醉科的要求，排除有严重呼吸道、心血管的疾病，有无哮喘、麻药过敏、严重的心脏疾病，这些要做相关检查。如果做无痛检查可能费用要多出一部分。普通肠镜费用总体不会超过1000元，因为还有泻药的费用。如果要做无痛肠镜，可能整体的费用在2000元钱左右。
