宝宝应当选择的自费的二类疫苗，主要有以下几种：

1、肺炎疫苗：如13价肺炎疫苗，13价肺炎疫苗可以预防由肺炎链球菌引起的一些侵袭性感染，比如重症肺炎、脑膜炎、败血症、中耳炎等，这些疾病会影响孩子以后的智力或听力，建议给2岁以下的宝宝接种13价肺炎疫苗；还有一种就是23价肺炎疫苗，这是适用于2岁以上的宝宝接种，道理等同于13价肺炎疫苗；

2、手足口病疫苗：手足口病疫苗也是自费接种的二类疫苗，建议宝宝也应该接种，主要是预防EV71病毒感染引起的重型的手足口病，重型手足口病的传染性比较强，而且可以导致宝宝死亡，危害比较大，所以建议要接种EV71的手足口病疫苗；

3、流感疫苗：流感疫苗也是自费的，流感相对于普通感冒，一般发热时间长，病情比较重，而且合并症比较多，比如可以合并重症肺炎，或者是中毒性脑病、坏死性脑病等，预后比较差，所以也建议给宝宝童接种流感疫苗；

3、流感嗜血杆菌的Hib疫苗：流感嗜血杆菌的Hib疫苗，能够预防由流感嗜血杆菌引起的比较严重的肺炎、败血症、心内膜炎等情况，所以对宝宝也是比较有意义的。

另外可以选择接种的自费疫苗，有水痘疫苗和轮状病毒疫苗。水痘疫苗，有的宝宝会出现严重的水痘，会合并有心肌炎或者脑炎等，通常病情比较重，建议接种水痘疫苗；还有就是轮状病毒疫苗，轮状病毒会引起比较明显的腹泻，会导致脱水和电解质紊乱，也可以接种这个疫苗来预防轮状病毒性肠炎。