肠套叠的典型症状是有阵发性腹痛、腹块、便血，肠套叠主要见于幼儿，常见于比较肥胖的幼儿突然之间的阵发性疼痛，但小孩由于不能表达，所以表现为哭闹，有时在肚子上可以摸到像腊肠样的肿块，小孩会出现便血、果酱样便。随着疾病进程，肠套叠可能会引起恶心、呕吐等肠梗阻表现，如果一直不能缓解，会引起血液循环障碍，表现为肠管坏死，出现腹膜炎体征、休克，最终导致死亡。
成年人也有肠套叠症状，但是并不典型。由于成年人腹壁较厚，摸不到腹部肿块，同时起病较缓慢，是因为各种原因引起，有可能是肿瘤性，也有可能是炎症息肉性所引起的套叠，而且进程较缓慢，一开始可能是不全性肠梗阻，后来发展为完全性肠梗阻。成年人的肠套叠往往有疾病基础，所以一旦有肠套叠的症状，要去积极治疗检查，必要时需要通过手术方法解决。
