美沙拉嗪主要是治疗溃疡性结肠炎，主要用于轻度溃疡性结肠炎的诱导治疗，以及中到重度溃疡性结肠炎的维持治疗。美沙拉嗪一旦用于溃疡性结肠炎的治疗，需要长期使用。初发病例，且局限于直肠型患者，有停药可能，但是有可能需要服用3-4年时间，对于反复发作的溃疡性结肠炎患者，甚至需要终身进行治疗。应用美沙拉嗪的治疗过程中，应该定期监测血常规和肝肾功能，明确是否发生药物副作用。
总体而言美沙拉嗪药物比较安全，多数患者没有出现明显副作用。如果溃疡性结肠炎患者随便停药会导致疾病反复，甚至疾病加重，从初期的直肠型、乙状结肠型可能演变为全结肠型。所以诊断为溃疡性结肠炎后要在专科医生的指导下规律用药，对于全结肠型溃疡性结肠炎患者，如果炎症控制不好，患结肠癌的几率会明显增加，但美沙拉嗪的维持治疗可以降低结肠癌的发病率，所以要在医生指导下规律用药。
