胆汁反流胃炎治愈的过程，主要是通过用一些吸附胆汁的黏膜保护剂，或者叫制酸剂，一般是铝碳酸镁。可以吸附一部分胆汁，同时可以在胃黏膜表面形成一个保护层，减少胆汁对胃黏膜的刺激和损伤，进一步促进胃黏膜的修复。如果没有铝碳酸镁，也可以用抑酸剂，减少胃酸对胃黏膜的刺激，减少胃液量，减少局部黏膜的炎症。
另外，可以加用一些黏膜保护剂，虽然不能吸附胆汁，但可以促进胃黏膜的修复，包括一些入血的，像惠加强即吉法酯片，或者是替普瑞酮。通过胃黏膜的修复，胃黏膜正常的防护层就得到修复。用药的情况下，一般5-7天，就可以得到正常修复。如果不用药，一般是2周左右，10-14天就可以治愈。
实际上胆汁反流性胃炎治疗原理，是促进黏膜的修复和增加黏膜的防御功能，但是并不能够减少胆汁的反流。实际上胆汁反流是一个逆流动的过程，所以并不会治疗或减轻胆汁反流，或者治愈胆汁反流，只能是治愈胃炎。
