四联药物即针对根除幽门螺杆菌的四种药物，由于药物不同，服用时间也有所不同，其中包括两种抗生素，建议在饭后服用，质子泵抑制剂与铋剂建议餐前服用，而在服用质子泵抑制剂后需间隔一段时间再服铋剂，否则两个药物互相作用，可能会影响代谢、吸收。
应用四联疗法时，如果没有严重不适感，建议坚持服药，足疗程的治疗才能有效根除幽门螺杆菌。如果在服药期间发现大便呈黑色，可能与服用铋剂有关。如果出现口苦、口涩、口腔有金属味，甚至排尿改变，则与服用抗生素密切相关。如果出现腹泻，大便不成形，可能是由于抗生素导致肠道菌群失调所引起，此时可加用地衣芽孢杆菌等益生菌调节肠道菌群，但应在服用抗生素后一段时间再服用益生菌，此时效果较为明显。
