霉菌性阴道炎即外阴阴道假丝酵母菌病，甲硝唑栓剂不能够用来治疗外阴阴道假丝酵母菌病。可能很多女性都会认为所谓的阴道炎症应用任何一种药物其实能够有效，可以运用任何栓剂，随便在药店里面购买即可。
但实际上对于不同种类的病原体所引起的阴道炎症，用药的选择也完全不一样，比如甲硝唑栓是适合于厌氧菌感染而导致细菌性阴道病。当阴道内的菌群平衡被破坏，导致原有的加德纳尔菌等这一类的厌氧菌出现异常增殖。
此时女性患者就会出现细菌性阴道病等相应的症状，比如外阴阴道的瘙痒，有的时候会出现很多略微稀薄的白带，而且这种白带非常具有特征性，就是腥臭味特别明显。所以应用甲硝唑来杀灭阴道内的厌氧菌时，效果非常良好，因此甲硝唑栓是用来治疗细菌性阴道病。
如果是外阴阴道假丝酵母菌病，是由假丝酵母菌异常增殖所导致，所以治疗首选是抗真菌的药物，比如应该应用克霉唑阴道栓剂或者制霉菌素阴道栓剂，也可以应用咪康唑的阴道栓剂。
如果应用上述阴道栓剂效果欠佳，在必要的情况下，甚至还可以应用口服的氟康唑片这一类的全身抗击真菌药物来进行治疗，通常情况下治疗也很好。
