短指症分为5种类型，遗传方式包括常染色体显性遗传和性染色体隐性遗传，如下所示：
1、常染色体显性遗传：其中前4种类型，即A、B、C、D4种类型，据现有的基因研究发现与常染色体显性遗传有关。也就是父代患有短指症，他的基因缺陷或变异传给子代的几率是50%，而且没有性别选择性。也就是后代是男性或女性都有50%的致病率，而且这种致病率是完全性外显，也就是后代获得基因缺陷或基因变异就可以表现为短指症，所以发病率比较高；
2、性染色体隐性遗传：短指症的第5种类型也就是E型，是一种性染色体隐性遗传疾病，也就是在性别上表现不同。如果患有短指症的是父亲，他传给后代中如果是传给儿子，男性传给男性，后代的表现正常，但是父亲传给女儿就有50%患病的几率。如果母亲患有短指症，传给后代就有性别选择性，传给女儿会表现为正常，而如果传给儿子会有50%的异常。
