儿童的扁桃体炎主要由于链球菌感染所引起，可以发展到化脓，所以也有时候称为化脓性扁桃体炎。链球菌感染容易合并急性肾炎和风湿热，所以必须进行有效的治疗。
青霉素和头孢类的药物对链球菌感染有效，所以应该采用足量、足疗程的治疗，一般都要7-10天。如果对于头孢类和青霉素类的过敏，可以选用大环内酯的药物，比如红霉素、阿奇霉素。
中医认为扁桃体炎可能跟上火有关，所以也可以辅助使用清热解毒的一些中成药。如果扁桃体经常发炎，平常也有打呼噜的情况，而且经常化脓不容易好，可以就诊耳鼻喉科，看是否需要手术治疗。
因为，只有及时地进行控制，才不容易发生急性肾炎和风湿热的合并症。
