卵巢囊肿如果较大，患者必须进行手术处理，因为较大的卵巢囊肿通常不会是生理性囊肿，均是病理性，所以患者出现病理性卵巢囊肿，必须手术治疗。手术方式有开腹和腹腔镜手术，通常对于不大的囊肿，如中等大小的囊肿，均考虑腹腔镜手术。
但是较大的卵巢囊肿，腹腔镜手术会有一定难度，因为如果卵巢囊肿较大，其占据腹腔位置较多，留给手术者操作的空间有限，操作时会增加难度，如果在较困难的手术时，还容易将囊肿碰破。
所以对于较大的囊肿，考虑开腹手术，因为开腹手术切口较大，能将囊肿完整剥除。通常在手术时需特别注意，尽量不要将囊肿碰破，因为在囊肿做病理检查前，还不能完全确定囊肿性质。如果囊肿存在恶性，此种液体外渗可能会增加恶性肿瘤的分级，对预后有影响。
