通常情况下，肺鳞癌比肺腺癌会较重，主要是指在年龄、性别、肿瘤分期和基础疾病等相似情况下。由于肺腺癌基因突变几率较高，部分患者可以通过吃靶向药或较长时间的控制。所以肺腺癌接受靶向药治疗的机会较多，肺腺癌对化疗、放疗的敏感性也比肺鳞癌要好，能够明显地延长生存期。
还有是肺鳞癌多数为中心型，易压迫气管、喉返神经，并发症也相对较多，所以肺腺癌会比肺鳞癌在预后方面会较好，肺鳞癌会显得较重。
但也要看到肺腺癌和肺鳞癌的预后是与肿瘤分期、患者心态、是否积极治疗、患者经济情况、家人的关心以及社会的关爱有明显的关系。
若肺腺癌和鳞癌都为早期，可以通过手术来切除，预后没有明显差别，所以强调平时要做到早诊断、早治疗，40岁以上的人应该每年体检1次，还有早发现、早治疗。
