灼口综合征是慢性疼痛性疾病，发病率越来越高，目前缺少一种确切有效的能够快速治疗的办法，因为该病的特点是以主观表现为主，灼口综合征没有客观的体征，而且致病因素也不明确，所以造成疼痛的原因也跟神经传导通路异常有关系。没有特别有效的治疗方法，只能尽可能的对因治疗，如有睡眠不好，需要调节，可以通过精神科或神经内科一块调节，所以治疗上需要各科共同配合。
如在诊疗时，可能还要用焦虑量表、抑郁量表和更年期量表来测，发现相关因素再去治疗。其中很重要的心理治疗，是灼口综合征治疗非常重要的部分，要控制抑郁、焦虑等精神疾病，以及疼痛等身心症状。在药物治疗方面，没有非常准确的针对灼口综合征的药物，一般如果有全身症状，如有更年期就纠正更年期，如果有轻度抑郁，可以用维生素或疏肝解郁，这种治疗方法很多，建议到精神心理科去做调节。
