黄痰是细菌感染的表现，而且是明确的、可应用抗生素的指征。所以在咳黄痰时可应用抗生素，但引起咳黄痰的疾病有很多，例如急性气管支气管炎、肺炎、肺脓肿等，根据不同的疾病所选用的药物不同，具体如下：
1、肺炎：此时可按照社区获得性肺炎的指南来应用一些药物，例如第二代头孢菌素、喹诺酮类的药物都可应用。此外，青霉素加酶的抑制剂、大环内酯类的药物也可应用；
2、肺脓肿：此时应用的抗生素要覆盖掉厌氧菌，因为肺脓肿有可能是有厌氧菌混合感染；
3、急性气管支气管炎：若咳黄痰是急性气管支气管炎引起，此时可应用二代头孢菌素、青霉素类药物、喹诺酮类药物；另外，还可应用一些化痰的药物加强痰液引流、帮助感染恢复，如乙酰半胱氨酸、盐酸氨溴索等。
