磁共振能检查神经系统，且磁共振是检查神经系统较好的检查手段。CT和核磁共振发明后，已经改写神经系统的诊断学，以前神经系统的诊断靠拿小锤敲敲打打进行定位，检查定性靠推算。而现在有核磁共振后，完全改变诊断的理念，怀疑有脑子器质性的病变，怀疑有脊髓器质性的病变，甚至于肌肉器质性的病变，均可进行核磁共振检查。

核磁共振是一个三维立体的检查，可发现很多CT发现不了的病灶，且还有各种各样序列检查，可进行功能磁共振。功能磁共振对脑细胞活动、脑血流情况、脑脊液的灌注情况，均可进行详细检查。目前神经系统疾病的诊断发展突飞猛进，发生跳跃式的进步。