食管上的胃肠间质瘤不一定要做手术。食管胃肠间质瘤发生较少，胃肠间质瘤好发于胃或者小肠，平时通过体检时行胃镜检查或者患者有症状，在做检查的过程中发现食道上有小隆起，这些隆起不一定是间质瘤，最常见的是平滑肌瘤。因此这一类的小间质瘤或者平滑肌瘤不需要手术，可以通过胃镜切除。小的肿瘤可以通过胃镜切除，但是较大的无法再操作，因此大一点的食管胃肠道间质瘤可能需要手术干预。
食道胃肠间质瘤一般发生较少、发现较早，食管胃肠间质瘤发生率大概在1%左右，往往需要内镜下处理，建议患者尽早处理。因为肿瘤长大以后需要手术干预，并且对生活质量也有一定影响。
