由于引起耳根部疼痛的原因不同，使用的药物也有所不同，常见如下：

1、急性中耳乳突炎：可引起耳后部乳突处压痛、触痛，以及表面皮肤的充血、肿胀，患者可全身使用抗生素进行治疗，包括头孢克肟、头孢地尼、头孢呋辛酯等头孢类抗生素，左氧氟沙星、盐酸左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素，以及克拉霉素、阿奇霉素、环酯红霉素等大环内酯类抗生素。同时，患者还可使用氧氟沙星滴耳剂、左氧氟沙星滴耳剂等抗生素滴耳剂进行耳浴；

2、皮肤感染：即耳后皮脂腺囊肿，也会引起耳根部肿胀、疼痛，从而造成皮肤红、肿、热、疼。患者可口服抗生素，也可局部涂抹百多邦、复方多粘菌素B、红霉素软膏等抗生素软膏进行治疗。