通常情况下，使用酒精擦一次阴囊后没有危害。酒精属于消毒剂，所以擦一次阴囊，对阴囊具有一定的消毒作用，通常没有危害。但酒精在消毒时具有一定刺激性，阴囊皮肤较嫩，所以使用带有刺激性的物品擦洗阴囊时，阴囊会有刺痛等不适感。

阴囊上有较多皱褶，其皱褶容易藏污纳垢，因此会出现阴囊炎。一旦出现阴囊炎后，可以选用刺激性较小，或者没有刺激性的消毒剂进行消毒，如新洁尔灭或者碘伏等，以免出现刺激感。