雷尼替丁和奥美拉唑均属于抑酸药，主要区别是作用机制不同，导致作用效果有所不同。雷尼替丁为H2受体拮抗剂，而奥美拉唑为质子泵抑制剂。质子泵抑制剂能更有效地阻止胃酸的分泌，作用较H2受体拮抗剂更强，持续时间更久。对于酸相关性疾病，特别是严重的疾病，首选质子泵抑制剂，如消化性溃疡急性期、胃食管反流病，尤其是重度反流性食管炎及上消化道出血的患者。
由于奥美拉唑这类的质子泵抑制剂抑酸作用较强、较持久，所以并不建议长期使用。长期的抑酸对胃黏膜存在影响，可能会导致神经内分泌细胞的增殖，甚至引起胃底腺增生，导致胃底腺息肉或神经内分泌肿瘤。患者应在医生的指导下系统用药，并不建议长期、无规律地使用药物。
