小孩扁桃体肥大手术是非常常规的手术，但是也存在一定的风险，因为切除扁桃体目前采用的方式最多见的是全麻下切除扁桃体，而全麻本身存在一定的风险。如果切除扁桃体，通常也会有术中或术后出血的风险，并且也会有感染的风险等。所以通常在小孩扁桃体肥大没有症状时，并不需要进行手术切除，一般小孩的扁桃体在10-14岁时会逐渐萎缩。
如果小孩经常发作急性扁桃体炎或急性化脓性扁桃体炎，每年发作3-4次，连续2年以上，则需要将扁桃体切除。另外，如果扁桃体肿大非常明显，会导致孩子出现打鼾，尤其是出现打鼾中间有暂停，出现睡眠呼吸暂停综合征。长期的缺氧会导致孩子出现一系列的缺氧症状，尤其是对于智力的影响，此时需要进行扁桃体的切除手术。
