支原体感染首先会导致阴道分泌物异常，比如白带颜色变黄、变绿、变灰，分泌物的量也会明显增多，同时还会造成阴道或者外阴瘙痒，分泌物本身刺激阴道或者外阴可能会引起皮疹等。所以对于支原体感染，首先需要进行白带检查以明确是否发生支原体感染，并给予相应治疗。
如果支原体上行感染，发展到宫颈甚至子宫内膜，输卵管以及盆腔，则会引起内生殖系统感染，称为盆腔炎。盆腔炎造成的影响较多，部分患者会引起长期慢性疼痛，部分患者则会影响输卵管和子宫内膜功能，从而造成不孕。但更多的患者只是造成轻度粘连，并没有任何特异性的盆腔症状。
所以支原体感染与它感染的部位、感染时间有很大的关系，从轻度的外生殖道炎症到严重的不孕，均可能由支原体感染引起。