卵巢囊肿抽液并不好，临床通常不使用此方法处理卵巢囊肿。当临床上发现卵巢囊肿后，要区分囊肿性质是生理性囊肿，还是病理性囊肿。
其中生理性囊肿是在月经当中会出现的一种生理性改变，最常见的囊肿是滤泡囊肿和黄体囊肿。此种囊肿无需手术，也无需药物处理。经过几个月临床观察，囊肿会自然消退。
而病理性囊肿，指卵巢的新生肿物。对于卵巢肿物，患者必须要采取手术的方法解决，通常不会采取穿刺抽吸的方法。因为穿刺抽吸可能使囊液外渗，也可能引起小破口。此办法仅是暂时性将囊内液抽出，并未从根本上解决疾病，所以在临床上不采取此方法。
通常卵巢囊肿的手术，采取腹腔镜的手术方式。腹腔镜可以行囊肿剥除术，或者一侧卵巢的切除术。通常年轻患者还是选择囊肿剥除，以保留患者卵巢。而对于年龄较大，如接近绝经年龄的患者，可以考虑做一侧卵巢的切除。
