甲状腺炎最常见的是慢性淋巴细胞性甲状腺炎，它是一种慢性的过程，又叫桥本氏病。还有一种亚急性甲状腺炎，病程相对较短。
桥本氏病治疗起来比较棘手，往往病程迁延很长的时间，如果症状不是很明显，一般不需要特殊的治疗。但是如果是短期内甲状腺出现明显的增大，患者有一定的症状，包括激素水平也有一定变化的情况下，有时候可能要配合一些激素的治疗。总体而言，慢性甲状腺炎不需要特别的药物治疗，只有在个别时候，症状变化比较明显的时候，会建议使用少量的激素制剂，比如出现甲亢的时候，可以进行抗甲亢的治疗，出现甲减的时候，可以补充甲状腺素。
亚急性甲状腺炎由于病程相对较短，在治疗上以抗炎治疗为主，包括减轻症状的一些治疗，包括使用非甾体类的抗炎药物，某些情况下也可以使用激素治疗，但都是以短期的治疗为原则。亚急性甲状腺炎的治疗比慢性桥本氏甲状腺炎的治疗要较为乐观，桥本氏病是一种比较麻烦的慢性迁延不愈的疾病。