食道溃疡最常见的病因是胃食管反流病，往往会造成食道下段的糜烂，甚至溃疡。对于胃食管反流病的治疗，首先要抑制胃酸的分泌，抑制胃酸的分泌中，包括质子泵抑制剂和组胺H2受体拮抗剂两大类药物，具体如下：

1、质子泵抑制剂：包括奥美拉唑、雷贝拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑等，这些药物能够不可逆的与胃黏膜上皮分泌氢离子的氢-钾-ATP酶相结合，阻碍其向胃腔内分泌氢离子，阻碍盐酸的形成，从而提高胃内的pH值，减少酸性的胃内容物对食道黏膜的损伤；

2、组胺H2受体拮抗剂：是抑制胃酸分泌的药物，这一类药物的抑酸效果不如质子泵抑制剂，包括法莫替丁、雷尼替丁、西咪替丁等，可用于病情比较轻的患者。促进胃肠动力的药物包括莫沙必利、伊托必利等，通过促进胃肠道的排空，减少胃内容物向上反流的几率。抗酸的药物包括铝碳酸镁等，能够快速的与胃酸中和，但是不能够持久的抑制胃酸分泌，可用于病情比较轻的病人。